哪些生物样本可用于酰基化组学分析？

酰基化组学（Acylation Proteomics）作为表观遗传学和蛋白质翻译后修饰（PTM）研究的重要组成部分，随着质谱技术的快速发展，酰基化组学研究得以实现对蛋白质上多种酰基修饰的系统性分析，包括乙酰化（Acetylation）、丙酰化（Propionylation）、丁酰化（Butyrylation）、苏酰化（Succinylation）等。研究这些修饰可以深入揭示细胞代谢状态、信号通路调控、疾病发生机制等。酰基化修饰的低丰度和动态性决定了样本类型与处理方式对实验结果具有深远影响。不同类型的生物样本可用于酰基化组学研究，根据研究目的和可获取性，常见样本类型如下：

酰基化组学可用的常见样本类型

1、细胞样本

细胞系是zuì常用于酰基化研究的模型系统，因其操作灵活、易于批量培养、可jīngquè控制实验变量。

• 常见细胞系：HEK293、HeLa、A549、RAW264.7等

• 原代细胞：人或动物来源的肝细胞、神经元、免疫细胞等

（1）适用场景

• 药物处理前后酰基化变化对比

• 敲除/过表达调控实验

• 稳定同位素标记（SILAC）定量研究

（2）注意事项

细胞裂解时必须添加脱酰基酶抑制剂（如TSA, NAM），以防修饰丢失；应冷链操作以保留蛋白状态。

2、动物组织样本

动物组织样本具有更高的生理相关性，适合研究酰基化在特定器官或疾病模型中的调控作用。

• 常见组织：肝脏、脑组织、心脏、肾脏、骨骼肌、小肠等

• 模型动物：小鼠、大鼠、斑马鱼等

（1）适用场景

• 肝脏代谢性疾病模型中的酰基化谱分析

• 神经退行性疾病中脑组织蛋白修饰变化

• 与转录组、代谢组联合进行多组学整合

（2）注意事项

组织采集后应立即液氮速冻，推荐采用低温研磨法提取总蛋白，并配合高浓度变性裂解液，避免修饰酶活性干扰。

3、临床样本

临床样本是实现基础研究向应用转化的重要材料，尤其适合酰基化标志物的发现与验证。

• 肿瘤组织：乳腺癌、肺癌、肝癌、胃癌等

• 体液样本：血浆、血清、尿液、脑脊液、唾液等

• 外周血单核细胞（PBMC）：兼具采集方便与免疫调控价值

（1）适用场景

• 癌症患者与健康对照组的酰基化谱比较

• 多组学联用挖掘潜在诊断/预后标志物

• 小体积样本高灵敏度分析（如血清酰基化肽段富集）

（2）注意事项

样本异质性较大，前处理流程必须标准化；百泰派克生物可提供临床样本小批量定制富集与分析服务，适用于探索性研究阶段。

4、模型生物样本

以遗传工程动物或模式生物为样本，可深入追踪特定修饰在不同发育阶段、组织或应激条件下的动态变化。

• 小鼠基因敲除模型（如Sirt3-KO小鼠研究线粒体去乙酰化）

• 果蝇/线虫用于高通量筛选研究

• 斑马鱼用于早期发育阶段的蛋白修饰变化研究

（1）适用场景

• 酶功能验证（去酰基化酶/酰基转移酶等）

• 代谢状态（如禁食/高脂饮食）与酰基化修饰关联研究

样本选择建议

不同研究目标对应的样本类型选择有所侧重：

样本处理与前处理注意事项

为确保酰基化修饰的完整性和数据的可靠性，样本采集和处理过程中需注意以下几点：

1、使用酰基化保护剂

• 加入HDAC抑制剂（如Trichostatin A, Nicotinamide）防止去酰基化

• 添加蛋白酶抑制剂，避免蛋白水解

2、快速冷冻&储存

• 组织样本应尽快液氮速冻并于-80°C保存

• 对体液样本建议加蛋白稳定剂后速冻

3、统一裂解体系

• 建议使用含8M尿素或SDS的裂解液，提高蛋白提取效率并保持修饰稳定

百泰派克生物科技：一站式酰基化组学解决方案

酰基化修饰研究中，从样本选择、前处理到后续质谱分析，每一步都决定了数据的深度与准确性。百泰派克生物科技依托自主研发的高效富集平台与先进质谱系统，提供如下服务：

1、样本类型广泛适配

• 支持细胞、组织、体液、临床样本的酰基化组学分析

• 提供定制化样本处理及富集方案，适配低起始量样本

2、多修饰联测能力

• 支持乙酰化、丙酰化、丁酰化、苏酰化等多种修饰并行检测

• 联合TMT/iTRAQ/SILAC等定量策略，提升数据解读维度

3、丰富生信分析内容

• 差异修饰蛋白筛选、GO/KEGG功能注释、通路富集分析

• 可视化酰基化位点分布、热图/火山图呈现表达变化

4、多组学整合

• 与常规蛋白组、代谢组、转录组联合分析，提升研究系统性

无论是机制探索还是临床转化，样本类型的合理选择是酰基化组学成功的dìyī步。结合研究目标、样本可获得性和技术要求，科学选型并配合标准化处理流程，将为高质量的数据获取和后续生物信息学分析打下坚实基础。百泰派克生物科技都可为您量身定制酰基化组学解决方案，助力揭示蛋白修饰在健康与疾病中的分子机制。如您有具体样本准备或项目设计需求，欢迎咨询百泰派克生物科技的zhuānyè技术团队。

百泰派克生物科技特色项目 一、蛋白测序 百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。 ※服务优势： 1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos; 2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖; 3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列; 4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带; 5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测; 6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。 二、蛋白质组学 百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。 ※服务优势： 1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物; 2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品; 3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高; 4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广; 5.zhuānyè生物信息学分析，分析更系统准确。 三、单细胞质谱流式技术分析 百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。 ※服务优势： 1.技术先进，填补技术空白 采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征，百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。 2.分析数量大，成本较低 单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。 3.应用前景大 ①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景； ②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰； ③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。 四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现 百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。 五、生物药物表征 百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。 百泰派克生物科技七大检测平台 百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商 北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。 1.公司采用ISO9001质量控制体系，zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务； 2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务； 3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等； 4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求； 5.服务3000+企业，10000+客户的选择； 6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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