蛋白质质谱鉴定流程
基于鸟枪法(shot-gun)LC-MS的蛋白鉴定流程
关于样品
1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品:
1-. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验;
2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容,我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验:
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
3. 银染的样品请不要进行脱色处理
液体样品(In solution format):
1-. 假如样品中蛋白量>10ug,我们对样品的缓冲体系没有要求;
2. 假如样品中蛋白量<10ug,样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用,并注意降低盐浓度;
3. 提交样品过程中,注意提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量;
Co-IP样品:
1-. 如果您洗脱的样品需要跑胶,请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可;
2. 如果您直接提交洗脱样品,我们推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA)缓冲体系进行蛋白洗脱,保证洗脱缓冲体系与后续的质谱实验兼容;
样品运输:
1-. 我们推荐您将样品冻干后进行运输,冻干样品中蛋白非常稳定。
2. 液体样品推荐干冰运输,短途运输冰袋也可以。
注意事项:利用质谱进行蛋白样品的鉴定,在样品准备过程中需佩戴手套和头套,尽量避免自身角蛋白(keratin)对样品的污染。
研究案例
该项目是中国科学院生物物理所一位老师将她的Co-IP的样品寄给我们进行蛋白鉴定。得到的部分结果如下图所示:
蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例
从图中可以看出,我们提供的结果报告中包含鉴定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage,鉴定出的肽段信息,鉴定出的肽段的修饰信息以及对鉴定到的蛋白的详细描述。
中/英文项目报告:
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1-. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 鉴定的蛋白质详细信息
蛋白胶点、胶条、IP样品质谱鉴定一站式服务
您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告
百泰派克生物科技-您身边的生物质谱专家
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务,业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台,服务3000+企业,10000+客户的选择,致力于为您提供y_ō_u|z_h_ì的生物质谱分析服务!