如何选择合适的富集策略进行酰基化肽段捕获？

蛋白质酰基化（Acylation）作为一种重要的翻译后修饰（PTM），在调控细胞信号转导、基因表达、代谢调节等过程中发挥着关键作用。常见的酰基化类型包括乙酰化（Acetylation）、丙酰化（Propionylation）、丁酰化（Butyrylation）等，它们广泛存在于组蛋白和非组蛋白上，参与调控多种生理与病理过程，如肿瘤发生、炎症反应及代谢紊乱。由于酰基化修饰通常发生在低丰度位点，直接使用质谱检测难以实现高灵敏度和覆盖率。在质谱分析前，选择合适的富集策略对酰基化肽段进行有效捕获，是确保数据质量的关键步骤。

一、为什么酰基化肽段富集至关重要？

酰基化修饰具有以下分析挑战：

• 修饰位点丰度低，信号易被背景肽段淹没

• 多种酰基化共存，结构类似，难以区分

• 修饰可能影响肽段理化性质，降低检出率

针对这些问题，合理选择富集策略不仅能提高修饰肽段的检出数目，还能增强数据的定量准确性与重复性。

二、酰基化富集的主流策略综述

以下是目前主流的酰基化肽段富集方法，各有其适用场景和优劣势：

1、抗体亲和富集（Antibody-based Enrichment）

（1）应用于：乙酰化、丙酰化、丁酰化等赖氨酸酰基化修饰

（2）原理：利用修饰特异性抗体（如anti-acetyl-lysine）与酰基化赖氨酸结合，通过免疫沉淀实现特异富集。

（3）优势：

• 高特异性，适用于靶向特定类型酰基化

• 可实现大规模组学研究

（4）限制：

• 抗体质量差异显著，批次间稳定性需严格控制

• 不适用于未知或非常见酰基化类型

2、化学衍生化富集（Chemical Derivatization）

（1）应用于：广谱酰基化或低丰度修饰检测

（2）原理：利用酰基基团的化学反应活性进行标签标记或选择性捕获。例如通过Hydrazide固应固定酰基化肽段。

（3）优势：

• 对不同酰基化类型有良好适配性

• 易于串联富集步骤

（4）限制：

• 反应条件需jīngzhǔn控制，防止副反应

• 实验流程较复杂，易引入人为误差

3、组蛋白专属富集策略（Histone Extraction + Enrichment）

（1）应用于：组蛋白酰基化（如H3K27ac, H4K16ac等）

（2）原理：通过酸提或盐提法特异性提取组蛋白，再结合抗体或HPLC等手段富集修饰肽段。

（3）优势：

• 针对性强，提升组蛋白酰基化覆盖率与酰基化肽段捕获效率

• 适合表观遗传学研究

（4）限制：

• 样本来源局限（主要用于细胞或组织核提物）

• 不适用于非组蛋白研究

三、如何选择适合的富集策略？

在实际研究中，选择酰基化肽段富集方法应结合以下几个关键因素：

1、修饰类型与研究目标

• 已知类型（如乙酰化）：优先考虑高亲和力抗体富集进行酰基化肽段捕获

• 未知/新型修饰：推荐使用化学衍生化方法拓展检测范围

2、样本类型与质量

• 组蛋白富集：推荐先进行组蛋白提取+修饰特异富集

• 非组蛋白/复杂样本：适合采用化学策略或串联富集方式

3、可用试剂与仪器平台

• 抗体富集需配套高质量抗体及磁珠体系

• 化学衍生需配合高精度质谱平台保障酰基化肽段捕获数据质量

4、项目预算与通量要求

• 高通量组学研究：选择稳定、高重现性的抗体平台

• 探索性课题：采用多策略并行验证更具性价比

四、百泰派克生物科技：一站式PTM组学解决方案提供者

在酰基化等翻译后修饰研究中，富集策略的选择直接决定了质谱分析的深度与准确性。百泰派克生物科技依托蛋白质组学经验，构建了覆盖抗体富集、化学衍生、组蛋白分离等多策略的标准化平台，可针对不同实验需求提供定制化服务。

我们的服务优势包括：

• 多种酰基化类型抗体库，验证良好

• 高分辨质谱仪（Orbitrap Eclipse、Exploris 480等）支持深度扫描

• 标准化数据分析流程，支持多维PTM交叉分析

• zhuānyè技术团队一对一方案设计与数据解读

选择合适的酰基化肽段捕获策略，需要综合考量修饰类型、样本特性与研究目标。对于乙酰化等常见修饰，抗体富集仍是主流手段；而对于新型酰基化或探索性研究，化学衍生策略更具灵活性。借助百泰派克生物科技的多元化平台，您可获得高效、可靠的酰基化组学解决方案，助力揭示复杂生命过程中的PTM调控机制。

~~

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.zhuānyè生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征，百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

https://www.biotech-pack.com/index.html