多组学整合:TMT蛋白质组学结合转录组、代谢组的研究趋势

更新:2025-11-10 09:00 编号:44937536 发布IP:111.9.61.209 浏览:3次
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蛋白分析,代谢组学,多组学整合分析,单细胞分析,生物制药分析
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详细介绍

在生命科学研究日益精细化的jīntiān,单一组学技术已难以满足对生物系统全面理解的需求。尤其在复杂疾病机制解析、药物靶点发现和jīngzhǔn医学研究中,多组学整合(Multi-omics Integration) 正成为主流趋势。


什么是TMT蛋白质组学?

Tandem Mass Tags(TMT)蛋白质组学 是一种高通量、定量jīngquè的质谱分析技术,利用同位素标记实现多样本蛋白相对定量。相比传统的Label-free方法,TMT具有以下优势:

  • 可分析多达18个样本(TMTpro 18plex),提高数据一致性;

  • 批间差小,适合临床队列或多重复实验设计;

  • 适配多种样本类型,包括组织、细胞、体液等;

  • 兼容多级分离策略,提升低丰度蛋白的检出率。

多组学整合的科学逻辑:为什么TMT要结合转录组和代谢组?

生物系统是一个多层次、多维度的调控网络。仅靠蛋白质组数据,往往难以解释复杂表型或通路变化的全貌。整合转录组(Transcriptomics)与代谢组(Metabolomics)等层级的数据,可以在更广的维度上还原生物系统的运行逻辑。

组学类型研究层级数据特点研究价值
转录组RNA水平表达趋势显著,但不等于功能产物揭示转录调控
蛋白质组蛋白水平更接近功能执行层解析通路激活状态
代谢组代谢物水平动态响应快速,反映终端状态捕捉表型改变


联合分析TMT蛋白质组与转录组和代谢组,可以实现:

  • 发现关键调控节点:找出“转录-蛋白-代谢”联动变化的核心因子;

  • 提升结果解释力:多维数据交叉验证,降低假阳性率;

  • 构建jīngzhǔn疾病网络图谱:解析疾病进展的系统性调控机制。

多组学整合研究的热点应用领域

1、肿瘤异质性与jīngzhǔn分型

TMT蛋白质组+转录组可揭示肿瘤亚型间的表达谱差异与功能通路激活模式;结合代谢组数据,可挖掘代谢重编程机制。


2、免疫调控与疫苗研发

结合蛋白质组与转录组,可评估免疫细胞活化状态及细胞因子表达,代谢组则揭示能量代谢通路的变化,用于疫苗反应预测与个体化免疫策略设计。


3、药物作用机制与毒理研究

TMT蛋白组学可jīngzhǔn捕捉药物靶点变化;转录组提供转录层反馈;代谢组反映系统代谢扰动。三者结合,有助于构建“作用-反馈-表型”机制链条,为药物安全性评价提供系统视角。


多组学数据整合方法的技术进展

1、数据预处理与标准化

不同组学平台(如与LC-MS)输出的数据维度和尺度不同,需统一归一化、批次效应处理,常用方法包括:

  • Z-score标准化

  • log2变换

  • ComBat批次校正

2、网络分析与通路富集

通过构建共表达网络(WGCNA)、蛋白互作网络(PPI)与代谢通路图谱,可识别关键模块与核心节点。整合分析常用工具包括:

  • Ingenuity Pathway Analysis (IPA)

  • Cytoscape + ClueGO插件

  • MetaboAnalyst

3、机器学习与多组学预测模型

机器学习算法(如Lasso、Random Forest、XGBoost)被广泛应用于多组学数据挖掘,特别适用于生物标志物筛选与疾病分类模型构建。


百泰派克生物科技的多组学一站式解决方案

作为lǐngxiān的多组学服务提供商,百泰派克生物科技提供从样本前处理、组学数据获取到生信分析与结果可视化的全流程服务,具备以下优势:

  • TMT蛋白质组全流程优化平台,覆盖10μg-100mg样本输入,适配多种组织和体液类型;

  • 转录组测序+定制分析服务,支持bulk 、small RNA、lncRNA等类型;

  • 靶向/非靶代谢组全覆盖,与质谱平台无缝对接;

  • zhuānyè的多组学整合分析团队,支持自定义联合建模、通路网络图谱构建;

  • 可视化交付报告,便于快速理解研究逻辑与成果展示。

从分子机制解析到jīngzhǔn医学落地,多组学整合已成为现代生命科学研究不可逆转的趋势。TMT蛋白质组学凭借其高通量、稳定性的特点,是连接转录组与代谢组的关键桥梁。百泰派克生物科技致力于为科研人员提供高质量、系统化的多组学服务,助力科学问题的深入挖掘与成果转化。



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百泰派克生物科技特色项目


蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。


※服务优势:

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;

6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。



蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。


※服务优势:

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;

5.zhuānyè生物信息学分析,分析更系统准确。



单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。


※服务优势:

1.技术先进,填补技术空白

采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征,百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。

2.分析数量大,成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。



生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。



百泰派克生物科技七大检测平台




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系,zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;

2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;

4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;

5.服务3000+企业,10000+客户的选择;

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!



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成立日期2015年12月23日
法定代表人王素芹
注册资本100
主营产品蛋白组学,从头测序,生物制药分析,代谢组学
经营范围技术开发、技术推广、技术转让、技术咨询、技术服务;货物进出口、技术进出口、代理进出口;销售机械设备、化工产品(不含危险化学品)。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后依批准的内容开展经营活动。
公司简介百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发 ...
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