timsTOF Pro 在 4D DIA 蛋白组学中的应用优......

随着生物医学、药物研发和jīngzhǔn医疗的不断发展，蛋白组学技术正逐渐从基础研究走向临床转化。而数据无依赖采集（DIA, Data-Independent Ac）则因其高通量、高重现性、低缺失率等特性，在大规模蛋白质定量分析中崭露头角。但传统DIA方法仍面临“共碎片干扰严重、识别通量有限”等挑战。Bruker推出的timsTOF Pro质谱平台，通过引入4D（包含离子迁移谱）数据维度，大幅提升了DIA的性能表现。特别是结合其独创的PASEF技术（Parallel Accumulation–Serial Fragmentation），在蛋白质识别深度、定量准确性与通量之间实现了更优平衡。

什么是4D DIA？

传统DIA主要采集三个维度的数据：质荷比（m/z）、保留时间（RT）、以及碎片强度。4D DIA则在此基础上引入离子迁移时间（Ion Mobility, IM），形成m/z - RT - IM - Intensity的四维数据矩阵。

而timsTOF Pro内置的Trapped Ion Mobility Spectrometry（TIMS）模块，使得离子在气相中根据大小和形状被分离，有效增加了谱图的分辨率，并提升了肽段和蛋白质的识别能力。

timsTOF Pro 的核心技术优势

~~1、PASEF 技术显著提升扫描速度与灵敏度

传统DIA质谱在提高通量时往往牺牲灵敏度，而timsTOF Pro 的PASEF技术则打破这一限制：

• 每秒可采集超过100张MS/MS谱图；

• 灵敏度提升可达10倍以上；

• 实现高深度、高速度的数据采集。

这意味着研究者无需进行过度分组或重复进样，也能获得丰富而准确的蛋白质定量数据。

2、4D分离提升谱图解析能力，减少共碎片干扰

离子迁移谱提供额外的分离维度，可有效区分m/z接近但迁移率不同的肽段，降低同窗干扰：

• 增强肽段识别率；

• 提高低丰度蛋白的检出能力；

• 有助于复杂样本（如血清、组织）的深度解析。

~~3、兼容多种4D DIA工作流，满足不同研究需求

Bruker 与多家软件开发方合作，推出一系列适配timsTOF的4D DIA分析流程：

• diaPASEF：zuì经典的4D DIA模式，适合高深度探索型研究；

• Slice-PASEF：适合快速大样本筛查场景；

• g-diaPASEF：结合标准品支持juéduì定量。

百泰派克生物科技：一站式高质量timsTOF蛋白组学服务提供商

作为专注于质谱技术和多组学服务的高端科研服务机构，百泰派克生物科技已率先引入Bruker timsTOF Pro 2平台，结合自主优化的4D DIA工作流程和数据分析策略，提供如下优势服务：

• 高深度蛋白质鉴定（>10,000蛋白/样本）；

• 稳定的定量精度（CV < 15%，支持Label-freejuéduì定量）；

• 定制化实验设计与生信分析报告；

• 快速交付（zuì快7个工作日）。

4D DIA结合timsTOF Pro，为复杂蛋白质组的全面解析带来了前所未有的可能。其出色的速度、分辨率和数据质量，使其成为当前zuì具发展潜力的质谱平台之一。如果您正计划开展高通量蛋白组学研究，或希望借助先进技术深入挖掘生物标志物、疾病机制，欢迎联系百泰派克生物科技，获取定制化方案与技术支持。

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百泰派克生物科技特色项目

蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.zhuānyè生物信息学分析，分析更系统准确。

单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征，百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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