TMT定量蛋白质组学在药物开发与生物标志物发现中的应用

随着jīngzhǔn医学与生物制药的发展，蛋白质组学已成为药物开发和疾病标志物研究的核心技术之一。在众多定量策略中，基于 Tandem Mass Tag（TMT）的多重标记质谱技术因其高通量、低批次差异和高定量精度，已广泛应用于药物靶点筛选、作用机制研究和生物标志物发现。本文将系统解析 TMT 定量蛋白质组学在药物研发及标志物研究中的应用价值、流程要点与zuì佳实践。

一、TMT 定量蛋白质组学的核心优势

1、高通量与低批次效应

（1）一次 LC-MS/MS 分析可处理 10–18 个样本，大幅减少实验批次带来的系统偏差；

（2）适合大规模临床队列或药物筛选项目。

2、高灵敏度与jīngquè定量

（1）样本混合处理后共同进入质谱分析，降低技术波动；

（2）配合 MS3 或 SPS-MS3 工作流，能有效缓解比值压缩，确保差异蛋白可信。

3、广泛的适用性

适配细胞、组织、血清、脑脊液及外泌体等复杂样本，满足从基础研究到临床转化的不同需求。

二、在药物开发中的应用

1、药物靶点发现与验证

（1）通过对药物处理组与对照组的蛋白质组比较，筛选受调控的差异蛋白；

（2）结合功能富集和信号通路分析，锁定潜在药物作用靶点。

2、药物作用机制解析

（1）追踪药物处理下蛋白质动态变化，识别关键调控节点；

（2）揭示药物对细胞代谢、信号通路及翻译后修饰的影响。

3、药物筛选与毒性预测

（1）利用 TMT 技术评估候选药物对多种细胞类型的影响；

（2）发现与毒性或副作用相关的蛋白变化，为药物安全性优化提供依据。

三、在生物标志物发现中的应用

1、疾病诊断与早期预测

（1）比较患者与健康对照的血清或组织蛋白质组，筛选候选生物标志物；

（2）结合统计学与机器学习方法，建立预测模型。

2、治疗反应监测

（1）追踪患者治疗前后的蛋白质动态变化，寻找疗效相关指标；

（2）辅助药物反应分型与个体化治疗。

3、预后与风险分层

（1）发现与疾病进展、复发风险相关的蛋白质特征；

（2）为临床决策提供支持性证据。

四、典型工作流程

1、样本制备与 TMT 标记

（1）统一的蛋白提取与消化 SOP，避免批次差异；

（2）利用 10plex、11plex 或 18plex TMT 标签，根据队列规模选择合适设计。

2、质谱分析

（1）采用高分辨率 Orbitrap 或 timsTOF Pro 平台；

（2）配合 SPS-MS3，提高低丰度蛋白定量精度。

3、数据分析

（1）数据库检索（UniProt/Human、Mouse）；

（2）Reporter 离子强度归一化、差异蛋白筛选（Fold Change ≥1.5，p<0.05）；

（3）通路富集（GO、KEGG）及网络构建。

五、百泰派克生物科技的 TMT 解决方案

百泰派克生物科技提供端到端的 TMT 定量蛋白质组学服务，涵盖：

1、 18plex 高通量检测，适合大队列药物开发和临床研究；

2、MS3/SPS-MS3 工作流，显著降低比值压缩，确保结果准确；

3、 从样本处理到差异分析、通路富集、网络构建的全流程服务；

4、 适配多样本类型，覆盖细胞、组织、体液及外泌体。

我们致力于为药物研发团队和科研人员提供高质量、可转化的蛋白质组学数据，加速药物发现与jīngzhǔn医疗。

TMT定量蛋白质组学以其高通量、低批次偏差和高精度，已成为药物开发与生物标志物研究的关键工具。通过合理的实验设计、先进的质谱平台及zhuānyè数据分析支持，科研人员能够更快、更可靠地发现药物靶点和疾病标志物。如需开展基于 TMT 的蛋白质组学研究，或规划药物开发与临床转化项目，欢迎联系百泰派克生物科技，获取zhuānyè的技术方案与合作支持。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.zhuānyè生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征，百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

https://www.biotech-pack.com/index.html