高通量泛素化蛋白组学的优势与当前挑战

泛素化（Ubiquitination）作为zuì重要的翻译后修饰之一，广泛参与细胞周期调控、DNA修复、信号转导与蛋白质降解等生物学过程，是维持细胞稳态与调控信号通路的核心机制。泛素化修饰具有低丰度、动态变化快、链型复杂等特点，长期以来难以实现系统性和高分辨率的检测。传统方法多局限于低通量或特定蛋白水平的研究，难以满足对泛素调控网络全景式解析的需求。随着高通量质谱技术、特异性富集抗体和定量标记策略的不断进步，高通量泛素化蛋白组学（Ubiquitinome Profiling）应运而生。这一策略不仅可在全蛋白组尺度上解析泛素化位点、链型与动态变化，还能够结合多组学数据，构建复杂的泛素调控网络图谱，显著加速了对泛素化生物学功能的理解。

一、高通量泛素化蛋白组学的技术优势

1、高灵敏度识别泛素化位点

现代质谱平台（如Orbitrap Eclipse、Exploris系列）配合高选择性泛素残基抗体（如K-ε-GG）富集策略，可实现泛素化位点的高灵敏度识别。相比传统免疫印迹或免疫沉淀方法，泛素化蛋白组学在通量和定量精度上具明显优势。

2、多样本并行定量分析

通过与TMT/iTRAQ等异重标记技术结合，可实现不同处理组（如药物刺激、基因敲除）之间的泛素化差异表达分析。这种并行定量能力对于机制研究与药物靶点筛选具有极高价值。

3、泛素链类型解析能力提升

不同泛素链（如K48、K63、K11）在细胞功能中扮演差异角色。借助串联质谱与多级碎裂技术（如EThcD），研究者可以区分泛素链连接类型，深化对泛素信号网络的理解。

二、高通量泛素化蛋白组学当前挑战：从技术瓶颈到数据解释

1、富集效率与特异性受限

K-ε-GG抗体是当前主流方案，但其对泛素化位点识别仍存在富集偏好问题，可能导致特定蛋白或位点的低覆盖。优化抗体纯度与富集流程仍是提升数据完整性的关键。

2、泛素化修饰本身低丰度、动态性强

泛素化是一个快速且可逆的过程，往往在细胞中处于低丰度状态。如何在复杂背景中稳定捕获这些修饰信号，是实验设计和样本前处理的技术难点。

3、生物信息分析工具仍不完善

目前适用于泛素化蛋白组的数据分析工具相对较少，尤其是在泛素链拓扑结构分析、修饰网络建模方面仍处于发展阶段。研究者迫切需要更智能的算法支持数据解读。

高通量泛素化蛋白组学作为研究细胞命运决策机制的重要工具，正持续拓展其在肿瘤、神经退行性疾病与自身免疫等研究领域的应用边界。面临诸多技术与解析挑战，但随着样本处理工艺优化、质谱性能提升与算法创新，未来高通量泛素化蛋白组学将进一步释放其在jīngzhǔn医学中的潜能。在泛素化蛋白组学领域，百泰派克生物科技依托先进的质谱平台与成熟的富集优化流程，提供覆盖K-ε-GG富集、标记定量、泛素链解析与生信分析的一体化解决方案。我们专注于提升低丰度修饰蛋白的检测覆盖率，并可根据客户研究目标定制个性化实验策略。无论您关注的是泛素化与药物作用机制的关联，还是蛋白降解信号通路的调控研究，我们都能提供可靠、高重复性的数据支持，加速科研进展。百泰派克生物科技将持续推动泛素化修饰组学的应用落地，助力科研人员探索更多未知的蛋白调控机制。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.zhuānyè生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征，百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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