当股东（出资人）已注销时，被投资企业办理注销的流程可以归纳如下：
明确注销责任主体：
如果已注销的股东（出资人）有上级主管单位，则由上级主管单位依规定办理相关注销手续。
如果已注销企业有合法继受主体（如继承人或受让方），则由继受主体依有关规定申请办理。
如果已注销企业无合法继受主体，则由已注销企业注销时登记在册的其他股东（出资人）申请办理。
成立清算组：
无论因何种原因解散，被投资企业都应在解散事由出现之日起十五日内成立清算组，开始清算。
有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成。
完成清算程序：
清算组需整理公司财产及债权债务，设立清算账户，处理与清算相关的公司未了结的业务，收取公司债权，参与公司的诉讼活动，处理公司财产，并制定清算方案。
清算组在确认并实施清算方案后，应提交清算报告。
注销公司国、地税登记证：
到国税和地税部门办理注销手续，按要求填写、签字、盖章、缴销发票、补税后，分别收回国税和地税税务登记证。
办理公司注销备案：
在公司主管工商局办理公司注销备案手续，提交清算报告和其他相关材料。
其他注销事项：
根据需要，到shebao局注销shebao账号等。
公示和公告：
在清算期间，通过登报等方式进行公示，告知相关利益方公司清算和注销事宜。
以上信息仅供参考，更多登报问题联系我们详询！