自下而上蛋白组学分析策略的应用受到选择性剪接形式的不完全或模糊表征、多样的翻译后修饰和内源性蛋白质裂解的限制。随着分析工具的进步，自上而下的策略得到了更多的应用。除了FT-ICR质谱仪外，orbitrap质谱仪的发明和创新推动了自上而下蛋白质组学的发展。
蛋白质结构鉴定
由于蛋白质在分析前不需要消化，采用自上而下的策略可以保持和检测采用鸟枪法时丢失的信息，如含二硫键的四级结构，这是自上而下法在蛋白质水平上表征二硫键等翻译后修饰的独特优势。也使自上而下法在如胰岛素等蛋白质治疗剂QC分析重组蛋白是否正确表达、折叠和组装中得到越来越多的应用。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap FusionLumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱，提供自上而下的蛋白质结构表征服务。
百泰派克生物科技-您身边的生物质谱专家
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd.简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务，业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台，服务3000+企业，10000+客户的选择，致力于为您提供y_ō_u|z_h_ì的生物质谱分析服务!