在进行股权转让时，公司需要提交以下文件给工商行政管理部门进行股权变更登记：
公司法定代表人签署的《公司变更登记申请书》。
《企业（公司）申请登记委托书》（如有委托）。
公司章程修正案或者新的公司章程。
法律、行政法规、国务院决定规定变更公司登记事项必须报经审批的，提交有关部门的批准文件。
按章程的规定出具的关于股权转让的决议（股东会决议或董事会决议）。
转让双方签署的股权转让协议。
新股东的法人资格证明或者自然人身份证明。
企业法人营业执照正、副本。
请注意，如果股权转让涉及国有资产，还需提交国有资产管理部门的批准文件，并且股权转让协议可能需要经过产权交易机构监证；如果不涉及国有资产，股权转让协议应当办理公证1。
