蛋白质的氨基酸序列是决定蛋白质结构和功能的基础,蛋白测序即对组成蛋白质的氨基酸种类和排列顺进行测定,是蛋白组学研究中的重要内容,常见方法包括质谱法(如串联质谱)和Edman降解法。未知蛋白(unknownprotein)通常是指那些尚未被充分研究和描述的蛋白质。这些蛋白质可能是由新发现的基因编码的,或者是已知生物体中的基因产物,但其结构、功能和作用尚未被完全理解。未知蛋白测序有助于揭示生物体的基因组和蛋白质组的全貌,对于研究蛋白质结构与功能,促进生物技术、药物开发和疾病诊断等领域的进步具有关键意义。
百泰派克生物科技BTP基于Thermo公司zuì新推出的Obitrap Exploris240质谱仪实现未知蛋白样品的序列分析,采用常用的6种蛋白酶(Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)分别对靶蛋白进行酶切和质谱测定,在得到碎裂肽段片段的经过肽段之间的拼接完成蛋白序列百分之百的测定。
百泰派克生物科技BTP未知蛋白测序流程
1.样品准备:
提取蛋白质,并通过纯化过程去除杂质。
2.蛋白分级/分离:
将蛋白质样品进行分级或分离,通常采用一维或二维凝胶电泳(1D/2D-PAGE)以及液相色谱(如HPLC)等方法。
3.蛋白酶切/消化:
通过多重酶解(如Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)将蛋白质分解成较小的肽段,便于后续进行质谱分析。
4.肽段分离:
采用液相色谱(如反相高效液相色谱,RP-HPLC)将蛋白酶切后得到的肽段分离。
5.质谱分析:
将肽段通过质谱仪进行分析,质谱分析的结果可以获得肽段的质量、电荷状态等信息。
6.肽段测序:
通过串联质谱(如MS/MS)对肽段进行的测序。
7.数据处理与分析:
使用专门的质谱软件如Mascot、Sequest等结合已知的蛋白质数据库对质谱数据进行分析处理。
未知蛋白测序技术的主要应用
1.新蛋白质的发现:
通过对未知蛋白质的测序和功能注解,可以发现新的生物催化剂、信号传导蛋白、转录因子等分子功能。
2.蛋白质功能研究:
通过测序蛋白质,为功能注释和蛋白质互作用网络研究提供数据支持。
3.疾病标志物发现:
通过对病理和正常组织蛋白质组的比较,发现潜在的疾病标志物,为疾病诊断和治疗提供线索。
4.药物研发:
用于鉴定药物作用的靶标蛋白,找到新的药物靶点,有助于加速新药的研发和优化。
关于样品
我们接受以下类型的样品:
1.纯化蛋白质:请提供纯度大于85%的蛋白质样品,建议送样量为50-200ug,蛋白浓度应在0.1-1mg/mL之间。
2.蛋白质组提取物:包括但不限于来源于细胞、组织或生物体的蛋白质组提取物。建议送样量为200-500ug,蛋白浓度应在1-5mg/mL之间。
3.蛋白胶点/胶条:1D-SDSPAGE分离的蛋白胶条,2DEPAGE中的蛋白胶点,IP、Co-IP样品及GST融合蛋白Pull-down等纯化样本中的蛋白/蛋白混合物。对于胶点胶条请保证蛋白质含量至少为10ng,对于免疫沉淀样本,请提供至少20ug的蛋白质。
中/英文项目报告
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 未知蛋白测序详细信息
4. 质谱图片
5. 原始数据
未知蛋白测序一站式服务
您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告
相关服务
蛋白测序
多肽测序
抗体测序
从头测序
蛋白从头测序和突变分析
蛋白全序列测定
蛋白质N/C端测序
生物制药N/C端测序
基于质谱的序列分析
基于Edman降解的蛋白质N端测序
基于PCR扩增的单克隆抗体测序服务
基于Topdown自上而下法的蛋白质测序
其他服务项目
优质检测平台
(1)基于生物化学、分子生物学、色谱的检测分析平台
该平台配备了Agilent 2100生物分析仪、ProteinSimple凝胶成像系统、高效液相色谱系统,为蛋白质组学、代谢组学分析保驾护航,包括样品制备、分离纯化分子量测量、杂质表征表达研究等:
(2)基于质谱技术的蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白测序平台
该平台配备了超高效液相色谱质谱联用,Orbitrap Fusion Lumos Tribri,Thermo ScientificExploris以及氢气交换质谱仪配合机械臂为蛋白贡组学、代谢组学和蛋白测序提供了全面的分析手段,包括蛋白质和代谢物的分离、质谱分析、结构分析以及动态信息研究;
(3)生物药物表征平台
该平台配备了DSC-FTRR差示扫描量热仪与傅立叶变换拉曼光谱仪,氢气交换质谱仪配备机械臂,为生物药物表征提供了全面的分析手段,包括生物药物的分离、纯化、结构分析和动态信息研究:
(4)基于10x Genomics的单细胞分析平台
该平台能够完成基于10xGenomics单细胞分析平台的检测流程包括单细胞分选、cDNA合成、文库制备、文库质量检测、PCR扩增以及高通量测序;
(5)基于Fluidigm的单细胞质谱流式检测平台
采用基于Fluidigm Helios流式细胞仪(Mass Cytometry Systemfor Single CellAnalysis)用于单细胞质谱分析,该平台能够完成包括单细胞捕获、cDNA合成、实时定量PCR分析、目标区域扩增以及质谱流式细胞分析;
(6)基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台
基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台,能够完成包括多肽分离、纯化、合成、质谱分析、免疫学检测以及分子相互作用研究;
(7)生信云平台
基于生物信息分析方法的生信云平台,能够完成一整套的生物信息学解决方案,包括组学数据的质量分析、差异表达分析、差异表达物GO、KEGG、COG注释分析、聚类分析、相互作用网络等多层次网络和通路的分析。
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。
1.公司采用ISO9001质量控制体系,提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;
2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;
3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;
4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;
5.服务3000+企业,10000+客户的选择;
6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!