亚细胞蛋白质组学
亚细胞蛋白质组学指针对细胞内不同区域结构功能单位的蛋白质组学研究。相对于全细胞蛋白质组学（涉及12000-40000种蛋白质），目前的蛋白质组学分析技术和工具适用于亚细胞蛋白质组学（涉及500-4000种蛋白质）的分析。亚细胞指细胞器或细胞区域，包括细胞膜、细胞浆、线粒体、溶酶体、过氧化物酶体、内质网、高尔基体和细胞核等。亚细胞蛋白质组学研究的意义在于有利于富集低丰度蛋白质、完善全细胞蛋白组、提供蛋白质的亚细胞定位信息以及加深对细胞分子机制的理解等。
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亚细胞蛋白质组学样本要求
在蛋白质组学研究中，根据样本类型、实验目标和分析方法的不同，样本的制备方法也有所不同。在亚细胞蛋白质组学研究中，对样本进行有效的前处理、分离得到高纯度的亚细胞组分是样本制备的关键。特别是后续要使用质谱进行蛋白质分析时，尤其要保证亚细胞蛋白质组学样本中的蛋白质纯度，避免研究目标以外的其他亚细胞蛋白质的干扰，因为质谱的灵敏度较高，污染蛋白质会影响分析结果的准确度。针对不同的亚细胞蛋白质组需采用相应的方法进行蛋白质的分离提取，如生物素标记就是亚细胞蛋白质组学中细胞膜蛋白质组学的一种分离高纯度膜蛋白的方法。
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