1-. 层次聚类分析
对筛选出的差异表达蛋白做层次聚类分析，将具有相同或相似表达模式的蛋白进行聚类。差异表达蛋白聚类结果如下图：
图1 差异表达蛋白层次聚类图
注：图中不同的列代表不同的样品，不同的行代表不同的蛋白。颜色代表了蛋白在样品中的表达量水平。
2. K-means聚类分析
为研究蛋白在不同实验处理下的表达模式，对样品的表达量进行K-means聚类分析，同一类的蛋白在不同的实验处理下具有相似的变化趋势，具有相似变化趋势的蛋白往往具有相似的功能：
图2 差异表达蛋白聚类折线图
注：x轴表示样品分组，y轴表示表达量。黑色线条表示这个cluster中的所有蛋白在不同实验条件下相对表达量的平均值的折线图。
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