在多样本比较、疾病机制解析与药物靶点筛选中,iTRAQ蛋白质组学以其高通量、高灵敏度和高一致性的优势,受到越来越多科研人员青睐。
iTRAQ蛋白质组学原理详解:如何实现多样本蛋白定量?
iTRAQ是基于质谱标记的相对和juéduì定量方法,利用同位素标签对不同样本中的肽段进行等质量标记,在MS/MS级别释放出不同质量的“报告离子”,通过其强度实现定量。
1、iTRAQ标记结构:
每个iTRAQ试剂由三部分组成:
(1)报告离子(Reporter group):114–121 Da,标志不同样本
(2)平衡组(Balance group):调节整体分子量一致
(3)肽反应基团(Peptide reactive group):与肽段N端和赖氨酸侧链反应多种标签等质量设计确保所有标记肽段在一级质谱中质量完全一致,在二级质谱中通过报告离子质量区分。
2、iTRAQ蛋白质组学实验流程:
(1)蛋白提取 → 胰蛋白酶酶解;
(2)每个样本分别用不同iTRAQ标签(如114、115、116…)标记肽段;
(3)所有标记肽混合,进行液相色谱分离 + 高分辨率LC-MS/MS分析;
(4)MS/MS碎裂时释放出报告离子(reporter ions),依据其强度进行定量;
(5)数据分析包括肽段鉴定、蛋白注释、差异分析等。
iTRAQ蛋白质组学的应用
1、疾病机制研究
通过比较健康与疾病状态下的蛋白表达谱,筛选差异表达蛋白,为疾病生物标志物挖掘和通路机制研究提供依据。
2、药物作用机制解析
通过比较药物处理组与对照组的蛋白质表达变化,探索药物靶点及其下游信号通路,为新药研发提供支持。
3、发育与时序研究
利用iTRAQ对不间点样本进行标记,实现动态监测蛋白表达变化,适用于胚胎发育、细胞分化等研究场景。
4、跨组学联合分析
iTRAQ常与代谢组、转录组等技术联合使用,构建多维组学关联网络,揭示复杂生物过程中的核心调控模块。百泰派克生物科技支持 iTRAQ 与磷酸化修饰、代谢组、免疫组学等数据的联合分析,助力构建系统生物学模型。
iTRAQ技术的局限与解决策略

iTRAQ作为成熟的多通道定量蛋白质组学技术,仍在生命科学、药物研究、转化医学等多个领域发挥着关键作用。其高通量、多样本并行定量能力,特别适合用于探索差异蛋白、构建调控网络、验证生物标志物等复杂课题。
百泰派克生物科技提供从样本准备 → iTRAQ标记 → 高分辨率LC-MS/MS → 数据分析与可视化报告的一站式iTRAQ蛋白质组学服务,并根据研究目的定制zuì优实验策略:
多样本设计与分组建议
报告离子干扰消除优化
生信分析深度挖掘
多组学联合分析支持
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百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
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百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
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百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
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2.分析数量大,成本较低
单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
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| 成立日期 | 2015年12月23日 | ||
| 法定代表人 | 王素芹 | ||
| 注册资本 | 100 | ||
| 主营产品 | 蛋白组学,从头测序,生物制药分析,代谢组学 | ||
| 经营范围 | 技术开发、技术推广、技术转让、技术咨询、技术服务;货物进出口、技术进出口、代理进出口;销售机械设备、化工产品(不含危险化学品)。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后依批准的内容开展经营活动。 | ||
| 公司简介 | 百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发 ... | ||