癌症研究中的TMT定量蛋白质组学

癌症是一类高度异质性和复杂性的疾病，其发生发展涉及基因突变、蛋白表达调控、信号通路紊乱等多层次生物学过程。高通量转录组技术（如）已广泛应用于肿瘤研究，但转录水平并不能完全反映蛋白质表达与功能状态。TMT定量蛋白质组学基于同位素等质量标签的相对定量方法，可对多个样本中蛋白表达水平进行高通量、jīngquè比较，在癌症研究中发挥出不可忽视的作用。

一、TMT在癌症研究中的技术优势

1、支持多组样本同步定量：适用于癌组织 vs 正常组织、不同分期肿瘤、药物干预前后等比较；

2、高灵敏度与高覆盖度：可捕捉到低丰度的癌相关蛋白；

3、重复性强，适合标志物筛选与验证；

4、支持翻译后修饰（PTM）研究，如磷酸化、乙酰化，深入挖掘信号通路激活状态。

常见的TMT标签包括TMT 6plex、10plex、11plex、16plex和TMTpro 18plex，意味着可在一次实验中并行处理zuì多18个样本。

二、TMT在癌症研究中的应用场景

1、癌症标志物发现与验证

TMT技术可通过对癌组织与邻近正常组织的蛋白表达谱进行比较，发现潜在的早期诊断标志物、预后相关蛋白或血清中可检测的分泌蛋白。

2、肿瘤亚型特征解析

许多癌种（如乳腺癌、胃癌、肺癌）存在明显分子亚型差异。TMT技术可帮助识别亚型特异性蛋白表达模式，揭示亚型间的功能通路差异，指导个体化治疗。

3、抗癌药物机制研究

TMT定量蛋白质组学可评估药物干预前后细胞或组织中蛋白表达变化，挖掘药物作用靶点与响应通路，辅助药效机制验证与副作用评估。

4、癌症微环境与免疫应答研究

通过TMT蛋白组学分析肿瘤相关免疫细胞、基质细胞与外泌体等成分，可解析肿瘤微环境（TME）对肿瘤生长、转移、免疫逃逸的影响。

（1）分析肿瘤浸润T细胞蛋白组，识别免疫疲劳标志；

（2）分析肿瘤来源外泌体，挖掘转移相关分子；

（3）配合蛋酸化组学，识别免疫信号通路激活状态。

三、TMT在肿瘤研究中的挑战与应对策略

百泰派克生物科技在癌症研究中积累了丰富的样本前处理、差异蛋白筛选、免疫通路挖掘等经验，确保数据质量与生物学解释力并重。

四、百泰派克生物科技的TMT定量蛋白质组学服务优势

针对癌症研究的多样化需求，我们提供zhuānyè的TMT蛋白组学技术服务：

1、支持多通道TMT标签（6plex~18plex），适配不同样本规模；

2、基于Orbitrap Fusion Lumos等平台，支持MS2与SPS-MS3，确保高精度定量；

3、一站式生信分析服务：从差异分析、通路富集、PPI网络到肿瘤亚型预测；

4、TMT + PTM联合分析：支持磷酸化、泛素化等修饰研究；

5、可扩展为多组学联合分析：如蛋白质组+代谢组+转录组一体化设计。

如果您正在开展肿瘤蛋白组学研究，我们可以根据您的实验目的、样本情况、预算需求，提供个性化项目设计与技术支持。TMT定量蛋白质组学不仅提供了对蛋白表达状态的jīngquè解析，还通过多通道高通量能力，加快了癌症机制发现与标志物验证的研究进程。通过与百泰派克生物科技合作，科研人员可将TMT技术的潜力转化为可靠的科研成果和临床价值。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.zhuānyè生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征，百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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