在蛋白组学研究中,质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink基于PEA(Proximity Extension Assay)技术是两类主流方法。两者各自具备独特优势,适合不同的研究场景与目标。本文将从技术原理、检测通量、灵敏度、定量能力及应用场景等方面对两者进行系统对比,帮助科研人员合理选择zuì合适的技术路线。
一、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink的核心原理
1、Olink PEA 技术
(1)基于双抗体探针结合目标蛋白,近距离寡核苷酸通过DNA聚合生成扩增模板;
(2)采用qPCR或NGS作为读出,检测灵敏度可达fg/mL;
(3)以预定义面板(zuì多约3000+蛋白)实现高通量分析。
2、质谱蛋白组学
(1) 样本经蛋白酶消化为肽段,利用LC-MS/MS进行分离与鉴定;
(2)无需抗体,理论上可检测上万种蛋白;
(3) 可通过DDA(Data Dependent Acquisition)、DIA(Data Independent Acquisition)或PRM(Parallel Reaction Monitoring)等模式进行定性或定量。
二、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink检测通量与覆盖范围对比
1、Olink PEA
(1)单次可检测数百至3000+目标蛋白;
(2)覆盖常见疾病相关通路(炎症、肿瘤、代谢等);
(3)受限于抗体面板,无法捕获面板外的新蛋白。
2、质谱
(1)理论覆盖度更高,尤其适合无偏全谱探索;
(2) 对低丰度、难检蛋白需优化前处理或富集;
(3) 高通量(数百样本)分析需较长仪器运行时间。
三、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink灵敏度与定量能力
1、灵敏度
(1)Olink可检测fg/mL水平蛋白,低丰度信号检测优于多数常规质谱;
(2)质谱对高丰度蛋白覆盖广,但低丰度蛋白需前处理富集或高灵敏度平台。
2、定量能力
(1)Olink输出相对定量(NPX值),需标准品换算juéduì浓度;
(2) 质谱可通过内标法实现juéduì定量,尤其适合药代动力学或定量验证。
四、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink适用研究场景
1、适合Olink的场景
(1)大规模临床队列研究(上千样本),高效检测预定义蛋白组;
(2)需要低样本量(1-3 μL)和高重复性的研究;
(3)快速筛选候选生物标志物。
2、适合质谱的场景
(1) 发现性研究:全谱探索、鉴定新蛋白、未知修饰;
(2) 需要juéduì定量或深度覆盖(尤其在机制研究)时;
(3) 开发个性化定制的靶向检测方法(PRM、MRM)。
五、百泰派克生物科技的综合解决方案
1、双平台集成
(1)为探索性研究提供质谱无偏鉴定;
(2)结合Olink高通量验证,实现标志物从发现到验证的完整流程。
2、生物信息学支持
(1)提供标准化数据处理(NPX计算、质谱峰提取);
(2)多组学整合(转录组、代谢组),帮助科研人员快速获取可发表成果。
Olink PEA与质谱是蛋白组学中互补的两大技术。前者适合大规模、低样本量、高灵敏度的高通量研究,后者则在全谱探索、juéduì定量及靶向验证方面具备优势。百泰派克生物科技结合两者优势,为科研团队提供从探索到验证的全流程服务,加速标志物研究及临床转化。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
※服务优势:
1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可实现对所测定靶蛋白序列 的覆盖;
3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;
4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;
5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;
6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
※服务优势:
1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;
2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;
3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;
4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;
5.zhuānyè生物信息学分析,分析更系统准确。
百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
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采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标进行表征,百泰派克生物科技可做到检测51个目标蛋白。
2.分析数量大,成本较低
单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
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| 成立日期 | 2015年12月23日 | ||
| 法定代表人 | 王素芹 | ||
| 注册资本 | 100 | ||
| 主营产品 | 蛋白组学,从头测序,生物制药分析,代谢组学 | ||
| 经营范围 | 技术开发、技术推广、技术转让、技术咨询、技术服务;货物进出口、技术进出口、代理进出口;销售机械设备、化工产品(不含危险化学品)。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后依批准的内容开展经营活动。 | ||
| 公司简介 | 百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发 ... | ||