在企业办理EDI许可证的过程中，存在着诸多常见误区：
误区一：觉得只有电商企业才需要办理EDI许可证。实则不然，只要企业业务涉及交易处理业务、电子数据交换业务、网络/电子设备数据处理业务，都得办理EDI许可证。
误区二：误认为外资无法办理EDI许可证。当下，外资企业完全可以办理EDI许可证，股权比例甚至能达到全外资控股，只需要向工信部走外资流程申请。
误区三：以为虚拟地址也可用于办理EDI许可证。但有些地区的管局在企业办理EDI许可证时，会进行实地考察，用虚拟地址办理并不保险。若办公地址与注册地址不一致，提供办公租赁协议即可。
误区四：认为办理EDI许可证对网站没有特定要求。和其他互联网资质一样，用于办理EDI许可证的网站，必须符合相关内容规则，否则无法通过审核。
误区五：觉得各地办理EDI许可证的要求和材料完全相同。实际上，由于各地管局会依据当地实际情况做出调整，以适配本地企业申请，各地EDI许可证办理要求和材料会存在一定差异。