北京海淀企业股权变更后，相关税收的计算和申报方法如下：
亲身经历分享
某企业股东将部分股权转让给新股东，在计算税收时，起初未考虑印花税，且在计算个人所得税时，误将转让收入当作应纳税所得额，未扣除股权原值。申报时，因资料准备不齐全，如未提供完整的股权转让协议和股东身份证明，导致申报被驳回。后来企业重新梳理了税务计算，补缴了印花税，正确计算了个人所得税，补齐了资料，才顺利完成申报。
税收申报
申报期限：扣缴义务人应于股权转让相关协议签订后 5个工作日内，将股权转让的有关情况报告主管税务机关。纳税申报应在次月 15 日内办理。
申报资料：一般需准备股权转让合同、股东会决议、公司章程修正案、股权转让双方身份证明、资产价值评估报告等。
申报流程
被投资企业备案：被投资企业登录北京市电子税务局，点击【我要办税】—【其他服务事项】—【其他涉税事项】—【被投资企业董事会 /股东会报告和个人股东 / 股权变动报告】，填写相关表格进行备案。
转让方提交申请：转让方是自然人，登录自然人电子税务局，点击导航菜单“我要办税”→“税费申报”→“分类所得申报”→“个人股权转让所得（试点）”，进入“股权转让资料填报模块”；转让方是企业，登录电子税务局，进入企业所得税申报模块，按要求填报各类信息表格并上传资料。
税收计算
印花税：
计算方法：按照股权转让协议所载金额的万分之五缴纳，交易双方均需缴纳。若协议中未明确载明金额，则按照实际结算的金额计税。
举例：若股权转让协议金额为 100 万元，双方各自需缴纳的印花税为 100 万 ×0.05%=500 元。
所得税
个人所得税：若转让方是个人，以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按 20% 的税率缴纳。如转让方以 30万元转让原购入价为 10 万元的股权，无其他合理费用，应纳税所得额为 30-10=20 万元，需缴纳个人所得税 20×20%=4万元。
企业所得税：若转让方是公司，需将股权转让所得并入公司的应纳税所得额缴纳企业所得税，基本税率为25%。若符合小型微利企业条件，有相应税收优惠。假设公司转让股权收入 100 万元，股权成本 60万元，无其他调整事项，应纳税所得额为 40 万元，若适用 25% 税率，需缴企业所得税 40×25%=10 万元。