商业特许经营备案的办理流程主要包括以下几个步骤：1、网上注册：特许人应当在中国境内的被特许人订立的1份特许经营合同之日起15日内，登录到商业特许经营信息管理系统网站进行网上注册。2、填报电子版信息：注册登录后，特许人需要按照系统提供的操作手册要求，真实、完整地填报电子版信息并提交上报。3、提交材料：特许人需要向省级商务主管部门提交包括特许经营基本情况、被特许人的店铺分布情况、市场计划书、营业执照、商标权和专利权注册证书等相关材料。4、审核：省级商务主管部门对特许人网上填报的电子版信息进行核对，并对特许人系统填报的备案材料进行审核。5、备案和公告：如果特许人的备案申请材料审核通过，省级商务厅将予以备案，并在商务部商业特许经营信息管理系统网站公告。6、补充材料：如果提交的申请资料不完备，特许人需要在7日内补充提交，补充齐全之日起10日内予以备案和公告，并向特许人发放备案证明。特许人还需要注意以下几点：
1、特许人应当拥有成熟的经营模式，并能为被特许人持续提供经营指导、技术支持和业务培训等服务。2、特许人应当拥有至少2个直营店，并且经营时间超过1年。 3、特许人应当自shouci订立特许经营合同之日起15日内，向商务主管部门备案。4、跨省、自治区、直辖市范围从事特许经营活动的，应当向商务部备案。5、提交的材料需要包括特许经营操作手册的目录、特许经营合同样本等。6、提交的文件、资料不完备的，商务主管部门可以要求特许人在规定时间内补充提交。