企业境外投资备案被拒后，修改申请材料可以参考以下步骤：
1.仔细研究拒批原因：认真阅读相关部门给出的拒批反馈意见，明确指出的问题和需要改进的方面。
2. 补充完善材料：
-针对材料不完整的情况，按照要求补充缺失的信息和文件。
-对于不准确的内容，进行核实和修正，确保数据准确、逻辑清晰。
3. 调整投资方案：
-如果投资项目不符合政策导向，重新评估并调整投资领域或方式，使其符合国家政策要求。
-优化投资计划和商业逻辑，进行更深入的市场分析、盈利预测等。
4.明确资金来源：提供详细合法的资金来源证明和说明，包括资金的筹集渠道和具体构成。
5.加强风险评估：全面评估投资可能面临的各类风险，并制定切实可行的应对策略。
6.完善尽职调查：对投资项目、合作方等进行更充分的调查，提供详尽的报告。
7.审核校对：修改完成后，对申请材料进行仔细的审核和校对，确保无误。
8.征求专业意见：如有必要，可以咨询专业的律师、财务顾问或相关领域专家，获取他们的建议和意见。
修改后的申请材料应重点突出对拒批问题的有效解决和改进，以提高重新申请的成功率。