1、个体工商户注册主体是个人，承担的的无限责任，如果你的企业出现欠债，个体破产，也会追究之前经营当中的欠款，直至还清。
公司一般注册的是有限责任公司，如果遇到赔偿欠款的，只承担有限责任，如果公司破产，不需要法人股东承担。
2、个体户只能个人经营，没有注册资金，没有股份不能转让，只能注销；
公司是股份制，有注册资金，有股份可以转让，也可以注销。
3、注册公司后期可以成立分公司，入股其他公司，可以多人合伙或者找投资人入股，个体户这些因为只是个人，都做不到。
4、个体户主要交的是个人经营所得税和增值税，相对税率较低。
公司主要交的企业所得税和增值税，相对税率更高。
5、个体户注册比较简单，不必须要开对公账户，不需要报税软件，报税比较简单。
公司注册手续更复杂一些，需要报税软件，开对公账户，要有专业的会计负责报税。
从整体市场发展来看。公司已经成为市场的主流，我们耳熟能详的大企业都是公司，尤其是做业务时很多企业必须要和公司合作，个体户级别太低，是不合作的，个体户更适合小级别的个人创业，例如小饭馆，发廊，装修队，小超市等等，但随着市场的变化，也有一些新兴行业加入了进来，比如微商，电商，网红，基本都是个人行为，都可以注册个体户，个体户税率低，报税简单，也更受个人创业者的青睐，是注册公司还是个体还要看你的行业和未来发展方向。