一、研究院分类：
工商注册研究院：
（1）研究院有限公司，这种和普通公司一样，只所属行业属于研究院，一样需要法人、股东、监事、财务等，与公司享有同等纳税盈利权利；
（2）研究院个人独资企业，这种的是由一个投资人组成的，结尾是研究院，也是和公司组成是一样的；
（3）研究院股份合作制，这种是由企业员工共同设立成立的，由多个股东组成，原则上不吸收其他股份，与公司形式基本一致；
（4）研究院（普通合伙）、研究院（有限合伙），这两种企业和普通公司一样的设立要求，只是所属行业不同；
在当地工商部门申请：
名称也是以研究院结尾，是盈利机构，便于企业的项目开展还有同行业企业的合作。
二、性质和目标有所不同：
1、工商注册公司
工商注册公司主要着眼于经济利益和商业运作。注册公司是一种明确法律地位和经济实体的行为，旨在为企业提供法律保护并规范商业活动。工商注册公司需要遵守国家工商行政管理部门的相关法律法规，并承担相应的税收和经营责任。注册公司可以经营多种商业活动，包括制造业、服务业和金融业等。
2、工商注册研究院企业
同样，工商注册的研究院企业不仅有民非研究院的性质，比如专注于科学研究和技术创新。给人的感觉是一种科研机构的形式，旨在推动科学进步和技术发展。研究院通常由一群专家和学者组成，致力于特定领域的研究工作，例如医药、信息技术或环境保护等。
但工商注册研究院企业又可以具有普通公司的可营利经营的性质。
三、经营方式、管理结构的差异。
1、在经营方式方面：
注册公司主要以盈利为目的，追求经济效益和市场竞争力。公司的经营活动包括产品生产、销售和服务等，通过与客户和合作伙伴的交流合作实现企业发展。
注册研究院可以和正常公司一样从事盈利业务，创造经济效益，但更注重科学研究的成果和技术创新的推广，通过发表学术论文和专利申请来宣传和推广科研成果。
2、在管理结构方面：
注册公司通常设有董事会、总经理和各部门负责人等职位，有明确的权责分工和决策程序。
注册研究院的管理结构相对简单，通常由院长和研究小组组成。
工商注册公司和注册研究院在目标、性质、经营方式、管理结构和法律责任等方面存在着明显的区别。注册公司还是注册研究院取决于经营者实际需求和目标。
