1-. 在蛋白质中磷酸化位点分析时应该注意些什么问题？
覆盖率：覆盖率越高，检测和鉴定含有修饰基团的肽几率就越大。
修饰位点的占有率：被修饰的蛋白质的百分比低，则检测到修饰肽的机会会随之减少。如果百分比较高（>30％），则有助于识别修饰位点。
2. 如何增加覆盖范围以定位磷酸化或甲基化位点？
首先，请注意，由于蛋白质序列的独特性，每种蛋白质在高序列覆盖率下都有不同的定位潜力。
蛋白质的覆盖率可通过以下方式增加：
a）有数量相对较多的蛋白质（Z_U_I好> 5μg蛋白质）用于质谱分析；
b）确保蛋白质是高纯度的；
c）可通过使用多种质谱仪器/技术进行分析；
d）可使用TiO2柱对磷酸化蛋白进行富集
3. 糖基化位点会抑制蛋白质样品的鉴定吗？
在蛋白质的纯度和浓度很高的情况下，基于质谱的蛋白质鉴定仍然是Z_U_I佳选择。但是，糖链（CHO）会通过以下机制破坏基于质谱的鉴定：
a）糖链可阻断胰蛋白酶裂解；
b）多变的糖链分子量，会降低对糖肽的检测；
c）解决方式：在凝胶上样和质谱分析之前，用N-聚糖酶（如PNGaseF）对N-linked糖链进行水解。
4. 我想对蛋白质中潜在的磷酸化位点进行初步分析。您公司费用Z_U_I低的先关服务是什么？有哪些限制？您有合适的建议吗？
我们成本Z_U_I低的初步分析是对来自凝胶或高纯度制剂的纯蛋白质使用MALDI-TOF/TOF的方法进行分析。
局限性：如果蛋白质很大，蛋白质不纯或产量低（<500 ng），蛋白质的覆盖率也会很低。
建议：如果能够提供高质量的样品，可大大降低初步分析的成本。（详情请咨询）
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北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务，业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台，服务3000+企业，10000+客户的选择，致力于为您提供y_ō_u|z_h_ì的生物质谱分析服务!