在蛋白质测序前,蛋白样品首先经过SDS-PAGE的分离,保证样品的纯度满足测序的要求;随后将SDS-PAGE上的蛋白样品转移到PVDF膜上;经过染色确定把蛋白条带并切出;使用Edman测序仪对得到的PVDF膜上的蛋白样品进行分析。Edman降解测序是通过循环反应从蛋白质的N端开始逐个鉴定氨基酸的种类,从而对蛋白质的N端序列进行测定。每一个Edman测序反应包括3步:第一步是在碱性条件下,PITC与蛋白N端的游离氨基结合;第二步是在酸性溶液中,N端残基被切除;第三步是PITC结合的残基转化成为更为稳定的PTH残基,经过在线的HPLC分析,根据洗脱时间确定氨基酸种类。
Edman测序反应过程
基于Edman降解的蛋白质N端测序服务流程
Edman测序实验流程图
应用领域
• 蛋白表达产物的验证:重组蛋白插入位点和表达顺序是否正确;
• 细胞株建立和发酵过程中蛋白产物的验证:验证细胞株建立和发酵过程中蛋白产物N端甲硫氨酸和信号肽是否正确处理;
• 蛋白降解/酶切分析:对降解/酶切形成的新蛋白片段N端进行分析,确定断裂/酶切位点;
• De-novo测序:对于蛋白数据库中不存在的全新蛋白序列进行分析。
关于样品
PVDF膜类样品的准备过程
1-.样品电泳和电转
a. 对蛋白样品进行1D或者2D跑胶
b. 将蛋白胶上的样品转移至PVDF膜上;注意:千万不要使用硝酸纤维素膜(Nitrocellulosemembranes)
c. 在此过程中请佩戴手套和头套,避免自身角蛋白对测序结果的影响
2.PVDF膜的染色
a. 染色过程中可以使用考马斯亮蓝或者立春红对PVDF膜进行染色;注意:千万不要使用银染的方法进行染色
b. 染色完成之后,可以使用双蒸水对PVDF膜进行清洗
c. 如果转膜的缓冲液中含有甘氨酸,需要对PVDF膜进行多次冲洗,以避免甘氨酸对后续分析的影响
d. 更详细的样品准备步骤,见Edman测序样品准备Protocol
3.靶蛋白条带获取
a. PVDF膜染色后,靶条带清晰可见,用洁净的解剖刀将靶蛋白条带切下
b. 在蛋白量允许的情况下,可以准备2-3条靶条带以增加靶蛋白的量
4.样品运输
对切下的蛋白条带进行密闭包装,使用冰袋运输即可
溶液样品的准备过程
1-.蛋白的纯度和用量
a. 样品需要量在1-10 ug
b. 样品纯度要>90%
c. Buffer中不要使用表面活性剂,并尽可能降低溶液的盐浓度
d. Tris, glycine, guanidine, glycerol, sucrose, ethanolamine,SDS, Triton, X-100, Tween和其他的去垢剂,ammoniumsulfate和其他的铵盐均会对后续的氨基酸鉴定产生影响,在样品准备过程中要避免使用
e. 样品准备过程全程佩戴口罩和头套,避免角蛋白的影响
2.蛋白样品的运输
a. 液体样品推荐干冰运输
b. 液体样品也可以在冷冻抽干或者真空抽干后,使用冰袋运输
研究案例
如下图所示,通过Edman测序,可提供鉴定的氨基酸的详细信息。
Edman测序研究案例
中/英文项目报告
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1-. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 蛋白质N端测序的详细信息
4. 质谱图片
5. 原始数据
百泰派克生物科技-您身边的生物质谱专家
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务,业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台,服务3000+企业,10000+客户的选择,致力于为您提供y_ō_u|z_h_ì的生物质谱分析服务!