自然界中发现的蛋白质大小从5kDa到400kDa不等。蛋白质水解过程将蛋白质切成较短片段,即肽段,蛋白质水解是肽质谱鉴定分析之前至关重要的一步,是蛋白质鉴定和表征、生物标记物的发现成功进行的基础。质谱可以研究完整的蛋白质,较小的肽更容易进行蛋白质鉴定。且可提高蛋白质的覆盖率,因为蛋白质覆盖率由于溶解性和异质性可能会降低。*常见的蛋白质组学方法往往会利用位点特异性酶切位点来产生较小的多肽片段。质量较小的肽段更容易通过高效液相色谱(HPLC)和HPLC偶联质谱进行分离和表征。
百泰派克基于质谱的蛋白鉴定示例
BTP-蛋白质水解服务
百泰派克生物科技提供两种水解蛋白质的方法:(1)凝胶内水解(聚丙烯酰胺凝胶基质中的蛋白质水解);(2)溶液内水解(蛋白质在氯仿/甲醇中沉淀,在尿素中再溶解后进行)。通过一维或二维凝胶电泳分离的蛋白质,可直接在凝胶内进行水解,凝胶内水解,有效且可重现好,但比较费力费时。相较于凝胶内水解,溶液内水解方法更省力,所需的时间较少,但溶液内水解的蛋白,蛋白的再溶解度低,可能会导致一定的样品损失。
蛋白质水解的流程
百泰派克生物科技可提供凝胶内水解和溶液内水解两种蛋白质水解相关服务。蛋白质水解的工作流程包括:
1-. 制备裂解液;
2. 溶液内或凝胶内进行酶切;
3. 使用离液剂(如尿素和胍)使蛋白质变性;
4. 使用DTT还原二硫键;
5. 使用碘乙酸或碘乙酰胺将半胱氨酸烷基化;
6. 去除试剂和交换缓冲液;
7. 在适当的pH和温度下,用胰蛋白酶或其他蛋白酶在碳酸氢铵缓冲液中过夜变性约18小时;
8. 加入酸类物质终止酶切。
9. 蛋白质富集/清洗。
蛋白质水解的工作流程
样品要求
百泰派克生物科技可处理各种类型的样本,包括但不限于:
天然来源的蛋白质;
重组来源的融合蛋白和标记蛋白;
不同亚型的抗体;
膜蛋白及其他。
蛋白质酶切的优点
• 灵活性:我们提供凝胶内和溶液内水解两种蛋白质水解策略;
• 高准确性和覆盖范围:我们的水解服务可以大大提高质谱分析的准确性和覆盖范围。
• 应用广泛:可促进蛋白质的鉴定和表征,发现疾病的生物标志物,并有助于理解生物学过程。
•完整的蛋白质组学服务:我们提供完整的蛋白质组学服务,涵盖蛋白质组学分析的整个过程,可对水解后的样品进行分析测定,一站式为您解决组学问题。
百泰派克生物科技还提供高通量自动化蛋白质水解服务,欢迎咨询。
代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。
代谢组学是在后基因组学时代兴起的一门跨领域学科,其主要目标是定量的研究生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本身基因突变而产生的其体内代谢物水平的多元动态反应。代谢组学诞生于上个世纪末,由英国伦敦帝国大学JeremyNicholson教授创立,之后得到迅速发展并渗透到多项领域,比如疾病诊断、医药研制开发、营养食品科学、毒理学、环境学,植物学等与人类健康护理密切相关的领域。
代谢组学
代谢组学发展至今,代谢组学技术已经远远超出了标准临床化学技术的范围,能够**分析数百至数千种代谢物。代谢组学提供了代谢表型的详细表征,并可以在许多水平上进行精密医学研究,包括表征疾病基础的代谢紊乱,发现新的治疗靶标以及发现可用于诊断疾病或监测治疗药物的活性。
*常见的代谢组学分析方法是质谱(MS)和核磁共振(NMR)光谱。质谱技术又分为LC-MS和GC-MS。其基本原理是使试样中各组分在离子源中发生电离,生成不同荷质比的带电荷的离子,经加速电场的作用,形成离子束,进入质量分析器。在质量分析器中,再利用电场和磁场使发生的速度色散,将它们分别聚焦而得到质谱图,从而确定其质量(质荷比),并通过质荷比的强度进行定量或半定量分析。NMR则是一种基于外部磁场变化引起的原子核能量吸收和再发射原理的光谱技术。NMR产生的光谱数据可用于量化浓度和表征代谢物的化学结构。
代谢组学技术的选择主要基于研究的目的,样品类型等。NMR所需的样品制备较少,并且产生的光谱与化合物浓度成线性关系。NMR的灵敏度相对较低,通常只能检测到*丰富的物种并且检测物质种类少,需要较长的纯化过程等因素限制了该方法的大面积使用。而质谱技术结合有效的样品前处理,以及与色谱分离相结合,具有很高的灵敏度和特异性,以及良好的动态水平,这使得质谱尤其是高分辨LC-MS特别适用于非靶向和靶向代谢组学。简单来说,只要该物质能够离子化并且被检测器捕捉,即可在LC-MS中被检测到。采用优化的样品前处理条件,根据检测目的选择不同的色谱质谱检测方法及流程化的操作规范,也是代谢组学分析成功的重要基础。百泰派克完善的标准操作程序(Standardoperating procedure, SOP)也为您的样品检测提供了有力的保证。
百泰派克代谢组学分析方案包括:
气相色谱-质谱联用 (GC-MS):常用于水溶性代谢物(需要衍生化)、部分脂类和有机酸的靶向分析。
液相色谱-质谱联用 (LC-MS):非靶向代谢组学,靶向代谢组学,非靶向脂质组学,靶向脂质组学。常用于氨基酸、糖类、醇类、有机酸、胺类、TCA循环中间体等水溶性小分子以及脂质大分子的靶向和非靶向分析
核磁共振法 (NMR Spectroscopy):常用于简单样品或纯化样品的的物质鉴定和分析
*除血液,血清等易处理样品外,来自细胞、组织、器官或细菌等样品均可进行代谢组学分析。
百泰派克生物科技-您身边的生物质谱专家
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务,业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台,服务3000+企业,10000+客户的选择,致力于为您提供**的生物质谱分析服务!